Будьте добры, подскажите, который из них который? Certbot от Let's Encrypt создаёт такой набор файлов:
cert.pem - нарушит многие конфигурации сервера, поэтому его не следует использовать.
chain.pem - используется для сшивания OCSP в Nginx >=1.3.7.
fullchain.pem - файл сертификата, используемый...