С точки зрения планировщика, тут разницы нет. Проверяется время, если оно совпадает (в каких-то пределах) со временем запуска задания, задание запускается. Решение, самое простое, не иметь заданий, которые бы запускались в момент перевода часов +-10 секунд (минимум).