К сожалению, в последней версии проблема не ушла. Более того, она стала вредна для текущего трека, так как если до установки метки end у трека была автоточка микширования, устанавливаемая в кроссфейдах, то после установки метки end точка микширования пропадает и трек играет до последней секунды.