djsoft, сделал чистую переустановку RadioBOSS.
Снимаем выше описанную галочку, и всё возвращаться как и было.
Тока всё равно непонятно, что делает энкодер так долго, при включенном контроле битрейта, при условии что не очень он и стабильным становиться:
ВЫКЛ: вход 64Kbps, выход 50-80Kbps
ВКЛ: вход 64Kbps, выход 60-80Kbps
НО в любом случае спасибо разработчикам, и Вам djsoft, за добавленную галочку.